
碧云天的BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (防污染型, 含示踪染料),即BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit with UDG and Tracking Dyes,是一种基于SYBR Green染料用于一步法反转录实时荧光定量PCR,即qRT-PCR (Quantitative Reverse Transcription PCR)或Real-time RT-PCR,含双染料示踪系统(with a dual-dye tracking system)的新型高品质防污染(Carryover prevention)试剂盒,主要用于RNA的特异性超高灵敏度定量检测。本产品可利用两种示踪染料混合后产生的变色效应追踪移液过程,方便用户分辨空白孔和加入qPCR Mix的孔,并确认体积较少的RNA样品是否已经添加到qPCR Mix中,可快速便捷的用于RNA的特异性超高灵敏度定量检测。本产品含有优化比例的高品质UDG酶和dUTP,可有效消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题造成的假阳性或CT值偏低。
UDG (Uracil-DNA Glycosylase),也称UNG (Uracil-N-glycosylase),可催化含尿嘧啶的DNA链中的尿嘧啶(dU)碱基和脱氧核糖之间的N-糖苷键发生水解,从而释放游离尿嘧啶,主要应用于消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题。其防止污染的原理为:在PCR反应中加入适量的dUTP,以dUTP替代dTTP掺入DNA中,形成含dU碱基的PCR扩增产物;后续进行PCR反应时,使用UDG酶选择性切割可能被污染而带入的之前PCR扩增产生的含有dU的单链或双链DNA,从而避免之前的PCR扩增产物可能的污染对于本次PCR扩增带来的负面影响。
在进行qPCR反应体系的溶液配制时,由于RNA样品加入的体积通常只有1-2微升左右,很难通过肉眼分辨是否已经加入了样品。本产品中的BeyoFast™ SYBR Green One-Step Reaction Buffer (2X, Blue)中添加有示踪作用的惰性蓝色染料,同时提供具有惰性黄色染料的模板稀释液Template Dilution Buffer (40X, Yellow),在配制qPCR反应体系时,随着两个组分的混合,溶液颜色会产生显著变化,即当黄色溶液加入到蓝色溶液中后,变成绿色溶液,从而可以根据液体颜色准确判断是否已加入RNA模板和qPCR mix,这就在加样过程中起到示踪作用,提高qPCR体系设置的正确率,避免漏加或错加模板等[1]。
本产品以提取的RNA为模版,使用qPCR引物在同一反应管内连续进行反转录和荧光定量PCR,操作简单快速,最大限度地减少人为误差,有效降低污染风险,节约PCR实验的操作时间,检测通量大。
本产品整合了高效的BeyoRT™ M-MuLV Reverse Transcriptase、RNase Inhibitor和优异的抗体结合型热启动BeyoFast™ Taq DNA Polymerase,并优化了缓冲体系,反转录性能优、检测灵敏度高、扩增特异性强、反应稳定性好,非常适合于内源低丰度RNA、外源病毒RNA等微量RNA的检测。
本产品中的BeyoFast™ SYBR Green One-Step Reaction Buffer (2X, Blue)使用SYBR Green I作为荧光染料,经反复验证,添加的蓝色和黄色两种惰性示踪染料的光谱与SYBR Green I不重叠,不会影响荧光定量检测,也不影响扩增体系的酶活性(图1)。SYBR Green I在游离状态下的荧光比较微弱,一旦与双链DNA结合后,其荧光会大大增强。通过检测荧光强弱就可以定量检测PCR过程中扩增产生的双链DNA的数量。

图1. 碧云天BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (含示踪染料)系列产品与BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit系列产品的扩增效果对比图。如图A-C所示,将RNA样品进行6个10倍梯度稀释,分别使用添加双重示踪染料的本产品(With tracking dyes)和未添加示踪染料的BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (D7268) (Without tracking dyes)进行扩增检测。图A、图B分别为本产品和D7268的扩增曲线图;图C为根据图A和图B扩增曲线的CT值绘制的标准曲线,横坐标为稀释后的样品经计算后的拷贝数的对数(Log10),纵坐标为对应的CT值;图D为分别使用添加双染料示踪指示剂的本产品和D7268对30个基因进行扩增,横、纵坐标分别为D7268和本产品扩增不同基因的CT值,结果显示两个产品使用效果基本一致。本系列产品的效果图以BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (含示踪染料) (D7612)为例,实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
本产品中使用的BeyoFast™ Taq DNA Polymerase是一种与抗体结合的高品质热启动酶,能够实现便捷高效的热启动。BeyoFast™ Taq DNA Polymerase中的Taq酶与抗Taq酶的单克隆抗体相互结合,从而抑制了Taq酶的DNA聚合酶活性,这样可以有效避免在低温条件下由引物和模板DNA非特异性退火或引物二聚体引起的非特异性扩增。在PCR反应的预变性步骤中抗体会被加热失活,这样可以确保仅在预变性后才会把Taq酶的活性释放出来,预变性之前不会发生DNA聚合反应,从而大大提高了PCR反应的特异性、灵敏度和定量检测的准确性[2, 3]。
本系列产品中的BeyoFast™ SYBR Green One-Step Reaction Buffer (2X, Blue)包含了蓝色示踪染料、PCR Buffer、dNTPs、SYBR Green I荧光染料、稳定剂和镁离子等所有的通用组分,使操作更简单、使用更便捷。用户只需自备引物、样品DNA和去离子水即可。
本产品提供了Low ROX和High ROX,广泛兼容于无需ROX和需要Low ROX或High ROX作为校正染料的荧光定量PCR仪。ROX的作用是用于校正与PCR无关的荧光波动,从而最大限度减少孔间差异。这种差异可能由多种因素引起,如移液误差及样品蒸发等。不同的荧光定量PCR仪对ROX的要求不同,请根据实际所用仪器在配制反应体系时选择高浓度ROX (High ROX)、低浓度ROX (Low ROX)或不加ROX。通常含高浓度ROX的BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (防污染型, 含示踪染料)也可以用于不需要ROX或需要低浓度ROX的荧光定量PCR仪。常用仪器所需ROX类型请参考如下表格。
添加ROX类型 | 适用PCR仪 |
不需添加 |
Bio-Rad: CFX384, CFX96, MiniOpticon, iCycler IQ, MyiQ and iQ5; Eppendorf: Mastercycler ep realplex and realplex2 s; Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 6000; Roche: LightCycler 480; Cepheid: SmartCycler; Illumina: Eco qPCR |
Low ROX |
ABI: 7500(Fast), ViiA 7, QuantStudio 6 and 7 Flex Systems; Stratagene: Mx3000P, Mx3005P and Mx4000; Qiagen/Corbett Rotor-Gene: 3000; Bio-Rad/MJ: Chromo4, Opticon 2 and Opticon; |
High ROX | ABI GeneAmp 5700; ABI PRISM 7000, 7700; ABI 7300, 7900HT(Fast); ABI StepOne(Plus) |
本产品稳定性好,在37ºC条件下保存3天不影响产品扩增效果(图2)。

图2. 碧云天BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (含示踪染料)系列产品的稳定性检测效果图。将37ºC保存3天与-20ºC正常保存的本产品用于相同模板的扩增对比分析,结果显示以上两种储存条件下qPCR产物CT值基本无差异。本系列产品的效果图以BeyoFast™ SYBR Green One-Step qRT-PCR Kit (含示踪染料) (D7612)为例,实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
相对于同类产品(Competitor),本产品颜色差异更显著、扩增性能更灵敏(图3)。

图3. 碧云天BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (含示踪染料)系列产品与国内同类产品(Competitor)的颜色差异与检测效果对比图。图A为本产品与同类产品稀释至1X时的外观颜色对比分析,第一列与第四列的蓝色孔(1X Blue)为稀释至1X的含蓝色示踪染料的SYBR Green qPCR Mix,第二列与第五列的黄色孔(1X Yellow)为稀释至1X的含黄色示踪染料的Template Dilution Buffer,第三列与第六列的绿色孔(Mixer)为稀释至1X的含蓝色示踪染料的SYBR Green qPCR Mix与含黄色示踪染料的DNA模板的混合物。经对比,本产品的颜色差异更显著,示踪效果更明显。图B为本产品与同类产品对标准品质粒的qPCR检测扩增曲线对比分析,相对于同类产品,本产品扩增的CT值更小,检测效果更灵敏。本系列产品的效果图以BeyoFast™ SYBR Green qPCR Mix (含示踪染料) (D7601)为例,实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
本产品如果用于常规的96孔板qPCR检测(建议反应体系为20µl),小包装可以进行100次检测,中包装可以进行500次检测;如果用于常规的384孔板qPCR检测(建议反应体系为10µl),小包装可以进行200次检测,中包装可以进行1000次检测。
保存条件:-20ºC避光保存,一年有效;4ºC避光保存,一个月内有效。尽量避免反复冻融。
注意事项:使用前需确保本产品完全融化,上下颠倒轻轻混匀后使用。混匀过程中尽量避免产生气泡。
请注意避免RNase污染,使用RNase-free的枪头,离心管等。
SYBR Green One-Step Enzyme Mix (20X, UDG)含有高浓度甘油,粘度高,使用前将短暂离心至管底,并用移液器轻轻混匀,混匀过程中尽量避免产生气泡,然后缓慢准确吸取。
如果扩增片段较长或者RNA结构较为复杂,可将模板RNA在65ºC预处理5-10分钟,可提高反转录效率。
本反应使用qPCR的Reverse Primer作为反转录的基因特异性引物,不能使用Random Hexamer Primer或Oligo (dT) Primer等常用于cDNA第一链合成的引物。
注意引物退火温度,当退火温度<60ºC时,推荐使用三步法PCR扩增。
BeyoFast™ SYBR Green One-Step Reaction Buffer (2X, Blue)中含有SYBR Green I荧光染料,保存本产品或设置PCR反应时应避免强光照射,以尽量避免荧光淬灭问题。对于超过350bp或者高GC含量的扩增片段,建议增加延伸时间至60秒或者采用三步法以提高扩增效率。
经测试,本产品反复冻融10次对使用效果无显著影响。但仍需尽量避免反复冻融本产品,反复冻融可能使产品性能下降。
qPCR检测是超高灵敏度的检测,尽管本产品有很好的防污染效果,PCR反应设置区域还是需尽量避免各种可能的待扩增产物的污染。PCR产物宜密封后丢弃,以避免超高浓度的PCR产物污染实验环境。
建议进行熔解曲线(Melt curve)分析以确定扩增反应的特异性。如果只有一个熔解曲线峰(对应的退火温度即双链DNA产物的Tm值),说明只有一种单一产物;如果熔解曲线出现双峰、多峰或杂峰峰,可能是引物二聚体或非特异性扩增、存在基因组DNA污染、试剂及环境被污染等。建议设置不含模板的对照(No template control, NTC),即反应体系中包含除模板以外的所有反应组分,根据样品孔和无模板对照孔熔解曲线的差异,可判断是否存在引物二聚体或其它的非特异性扩增。
超纯水推荐选购碧云天生产的BeyoPure™ Ultrapure Water (PCR级, Sterile) (ST873)。
qPCR的内参引物和目的基因引物推荐选购碧云天预先设计、经过qPCR验证、预混的引物对产品。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。